1925年11月,尚在校读书的黄文通毅然离开学校,参加韦拔群在北帝岩(后改为列宁岩)举办的广西第一届农民运动讲习所。讲习所刚结束,黄文通就同廖源芳、王子雄、廖由斌、陈天经、黄大权(东兰人)一起,回凤山建立长里、恒里、社更、袍里、老里、上林、月里等乡农会。黄文通变卖自己家的田地,购买枪支弹药,组织农民自卫军。
1927年12月,国民党广西省政府发出悬赏,通缉韦拔群、黄书祥、牙苏民、陈天经、廖源芳、黄文通、黄治峰等23个右江地区农民运动的领导人。也是在这个时候,韦拔群派黄文通赴广东海陆丰,去学习那里的农民运动经验。
1929年农历5月,黄文通从广东海陆丰回到南宁,在南宁加入了中国共产党,并受广西省农民部委任为凤山县农民运动特派员。这一年6月、7月,中共中央派邓斌、张云逸到广西工作,黄文通随张云逸来到百色。不久,黄文通从百色赶到东兰,向韦拔群汇报请示工作。韦拔群指示他立即赶回凤山,协同黄明春、廖源芳筹备凤山起义的工作。这一年农历10月10日,在东兰农军的配合下,凤山农军占领了凤山县城,宣告凤山县苏维埃政府的成立。黄文通任凤山县农会主席。此后,黄文通奉调回百色,参加百色起义的筹备工作。11月11日,著名的百色起义胜利举行,中国工农红军第七军同时正式成立,张云逸任军长,邓斌任党代表、军政委,黄文通就在军长张云逸身边工作,是邓斌、张云逸与第三纵队的直接联络员。
1930年10月上旬,红七军集中在河池休整,奉令准备北上与中央红军汇合。黄文通此时被任命为第二十师组织科科长,他本来是随主力红军北上的,但在1932年3月,党中央为了加强右江革命根据地的领导力量,决定派黄治峰(平果人,时任20师政治部主任)、黄文通等七位红军干部潜回右江工作。黄治峰和黄文通等七位同志离开主力部队后,化装成小商贩,回到思隆县(今田东县)时,不幸被叛徒出卖,七位同志全部被捕、杀害。黄文通牺牲时只有27岁。